MTsN 5 Madiun merupakan lembaga pendidikan yang berbasis keislaman yang mengintegrasikan ilmu umum dan agama dalam satu kurikulum yang holistik. Siswa tidak hanya cerdas secara intelektual, tetapi juga memiliki akhlak mulia. MTsN 5 Madiun juga mengembangan Minat dan Bakat peserta didik dengan menyediakan berbagai ekstrakurikuler menarik seperti seni, olahraga, pramuka, dan pengembangan keterampilan digital.